Automatická segmentácia kolennej chrupavky a meniskov pomocou konvolučných neurónových sietí

Program DŠ: Meracia technika
Akademický rok: 2019-2020
Meno školiteľa: Mgr. Vladimír Juráš, PhD. (umervjur@savba.sk)
Externá vzdelávacia inštitúcia: Ústav merania SAV
Prijímajúca škola: FEI STU v Bratislave, Ústav elektrotechniky
Max. počet študentov: 1

Anotácia:
Stanovovanie prognózy a sledovanie úspešnosti liečby pri osteoartritíde patria medzi dôležité úlohy, ktoré rieši muskuloskeletálna magnetická rezonancia (MRI). Skoré štádiá degeneratívnych poškodení chrupaviek a meniskov sú sprevádzané úbytkom proteoglykánov a porušením kolagénovej siete. Kvantitatívna MRI može v budúcnostsi pomôcť s detekciou stavu makromolekúl v spojivových tkanivách. Kedže manuálne vyhodnocovanie chrupaviek je príliš náročné, popularitu získavajú automatické metódy segmentácie chrupaviek a meniskov z MR obrazov. Konvolučné nerónové siete (convolutional neural network, CNN) poskytujú robustné a rýchle riešenie. Úlohou doktoranda bude navrhnúť architektúru CNN a natrénovať túto sieť na MR dáta získané jednak z celosvetovej databázy (OA Intitiative), poprípade je možnosť namerať dáta na najmodernejších MR prístrojoch buď na Ústave merania alebo na Lekárskej Univerzite vo Viedni. Predpokladom úspešného riešenia je záujem v programovaní (Matlab, Python) a v biológií/medicíne.

späť