Počiatok Ústavu merania je spojený s Laboratóriom pre výskum a vývoj meracích a fyzikálnych prístrojov. Toto laboratórium bolo založené v roku 1953 ako jedno z prvých laboratórií novo sa konštituujúcej Slovenskej akadémie vied. Počiatočným cieľom laboratória bol návrh, výroba a implementácia originálnych prístrojov určených na experimentálny výskum v rámci Slovenskej akadémie vied.

Vo februári 1963 sa Laboratórium premenovalo na Ústav teórie merania SAV. V roku 1976 ústav dostal názov Ústav merania a meracej techniky SAV. Od januára 1981 bol ústav včlenený do Centra elektro-fyzikálneho výskumu SAV. Terajší názov ústav získal v roku 1988.

Budova Ústavu merania SAV bola postavená v roku 1967. Patrí do areálu Slovenskej akadémie vied, situovanej v západnej časti Bratislavy na Patrónke, v blízkosti lesoparku.